La Chapelle a été érigée à partir de 1630 pour le compte de la confrérie des Pénitents Noirs. Mais cette Chapelle était trop grandiose pour la petite communauté et les confrères durent s'endetter pour continuer la bâtisse qui fut finalement achevée en 1656.
Saisie comme Bien National sous la Révolution, elle fut vendue en Septembre 1791.
Elle fut convertie en prison pendant la période fédéraliste puis passa par diverses mains avant d'être rachetée par le Curé Brunet qui y installa la confrérie de Sainte-Anne d'où son nom actuel.
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Source : DATAtourisme
— Office de Tourisme de La Ciotat